Nuolatinės parodos
Skarulių dvaro archeologinė ekspozicija rūsyje
Muziejaus rūsyje 2014 m. pabaigoje įrengta nauja ekspozicija, kurioje eksponuojami sunykusio Skarulių dvaro vietoje archeologinių kasinėjimų metu rasti kokliai, indai, kiti keramikos gaminiai, reprezentuojantys vieno svarbiausių Jonavos rajono dvarų praeitį.
Etnografinė ekspozicija
Etnografijos skyriuje eksponuojami iš Jonavos rajono gyventojų sukaupti senoviniai namų apyvokos daiktai, rekonstruoti senieji mediniai žaislai, tautodailininkų dirbiniai.
Istorijos skyriaus ekspozicija
Šiuo metu istorijos skyrius uždarytas rekonstrukcijai.
Dailės skyriaus keičiamos parodos
Dailės skyriuje nuolat vyksta Lietuvos menininkų parodos, valstybinių švenčių minėjimai, viešos paskaitos, filmų peržiūros, rengiamos teminės istorinės ekspozicijos. Parodos nuolat keičiamos, kas keletą savaičių.
